7089. Генетика. NGS. Мікробіом кишківника (кал, метод секвенування нового покоління)

NGS-аналіз мікробіому кишківника – це сучасне високотехнологічне дослідження, яке дає змогу визначити якісний та кількісний склад кишкових мікроорганізмів за допомогою секвенування ДНК. Метод дає змогу виявити понад 2000 видів бактерій, архей, грибів і вірусів, оцінити їхню відносну кількість, взаємозв’язки та вплив на стан здоров’я людини.

Мікробіом кишківника – це складна екосистема з трильйонів мікроорганізмів, які беруть участь у травленні, синтезі вітамінів (B12, K), формуванні імунітету, захисті від патогенів і навіть регуляції настрою та обміну речовин. Порушення балансу мікрофлори (дисбіоз) може призводити до низки патологій: метаболічного синдрому, ожиріння, СПК (синдрому подразненого кишківника), автоімунних процесів, шкірних захворювань тощо.

Секвенування нового покоління (NGS) – це група передових технологій, що визначають точний порядок нуклеотидів у молекулах ДНК. Ґрунтуючись на послідовності певних генів, NGS може ідентифікувати мікроорганізми, які є у зразку, аж до роду і навіть виду, щоб відповісти на запитання: хто там.

Для вивчення мікроорганізмів кишківника також використовують технологію метагеномного ДНК-секвенування, що дає можливість порахувати сотні видів бактерий, включно з тими, що не піддаються культивуванню в лабораторних умовах.  

Центральним елементом NGS-технології є аналіз гена 16S рРНК, що є універсальним і висококонсервативним маркером усіх бактерій та забезпечує точну ідентифікацію. Використання цієї техніки є еталоном для вичерпного аналізу мікробіоти визначення мікробного різноманіття кишківника для прогнозування стійкості або сприйнятливості до конкретних видів лікування, розуміння імунної взаємодії господаря і патогена та відстеження прогресування захворювання.

Коли?

Кому?